Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNPO1Q92973 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNPO1Q92973 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms