Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GTF3AQ92664 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3AQ92664 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms