Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM58Q8NG06 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM58Q8NG06 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM58Q8NG06 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms