Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC43Q8N309 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC43Q8N309 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms