Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLFN12Q8IYM2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms