Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NELFCDQ8IXH7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NELFCDQ8IXH7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms