Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LDLRAD3Q86YD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LDLRAD3Q86YD5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms