Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KIAA0408Q6ZU52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA0408Q6ZU52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms