Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRM9

Putative uncharacterized protein FLJ46235, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZRM9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6ZRM9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6ZRM9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms