Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LCLAT1Q6UWP7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms