Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRAMD4Q6IC98 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRAMD4Q6IC98 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms