Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VIRMAQ69YN4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms