Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG16L1Q676U5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms