Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM29Q5VYK3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms