Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms