Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZFYVE27Q5T4F4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms