Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD3Q5T447 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms