Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF6Q58WW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF6Q58WW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms