Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDCCQ504Y2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms