Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms