Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P3H1Q32P28 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P3H1Q32P28 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P3H1Q32P28 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P3H1Q32P28 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P3H1Q32P28 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
P3H1Q32P28 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms