Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C17orf58Q2M2W7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms