Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SWI5Q1ZZU3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms