Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FOXD1Q16676 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
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