Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ECM1Q16610 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ECM1Q16610 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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