Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX1Q16384 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SSX1Q16384 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SSX1Q16384 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSX1Q16384 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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