Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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