Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HNF4GQ14541 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HNF4GQ14541 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms