Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC3Q13507 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC3Q13507 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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