Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IKZF1Q13422 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IKZF1Q13422 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.4 ms