Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATMQ13315 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ATMQ13315 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATMQ13315 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATMQ13315 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATMQ13315 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATMQ13315 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms