Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACACAQ13085 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACACAQ13085 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms