Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HSPB3Q12988 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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