Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 AEP3YPL005W 1821 nt3.98□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YNL011CYNL011C 1335 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GAL11YOL051W 3246 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 SYF1YDR416W 2580 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 MSS4YDR208W 2340 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 NRG1YDR043C 696 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 YDR230WYDR230W 348 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PGD1YGL025C 1194 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 PEX18YHR160C 852 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 HIS5YIL116W 1158 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 RRP36YOR287C 903 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 JID1YPR061C 906 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 CTP1YBR291C 900 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 ROD1YOR018W 2514 nt3.97□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 GSM1YJL103C 1857 nt3.96□□□□□ -1.77
LCB4Q12246 AIM14YGL160W 1713 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 PUT2YHR037W 1728 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RGI1YER067W 486 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 OTU1YFL044C 906 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YGL109WYGL109W 324 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 ERV29YGR284C 933 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 CCE1YKL011C 1062 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RIB4YOL143C 510 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NCE102YPR149W 522 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 POP7YBR167C 423 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 snR37snR37 386 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 STP22YCL008C 1158 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 ULS1YOR191W 4860 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RAD1YPL022W 3303 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NTH1YDR001C 2256 nt3.96□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 CTF13YMR094W 1437 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 THI7YLR237W 1797 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 PRP11YDL043C 801 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YDR248CYDR248C 582 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 TLG1YDR468C 675 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 BIO2YGR286C 1128 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RPL27AYHR010W 411 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 SAE3YHR079C-A 276 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YJL147CYJL147C 1149 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 HUT1YPL244C 1020 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YPR147CYPR147C 915 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 OM14YBR230C 405 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 OAF1YAL051W 3144 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 SIP1YDR422C 2448 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 VHS3YOR054C 2025 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 IDS2YJL146W 1410 nt3.95□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MSN4YKL062W 1893 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 UGA3YDL170W 1587 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 VPS73YGL104C 1461 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MDM34YGL219C 1380 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 BSC2YDR275W 708 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 DPP1YDR284C 870 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 IES6YEL044W 501 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 FOL2YGR267C 732 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 DPH1YIL103W 1278 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YAL065CYAL065C 387 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MAP1YLR244C 1164 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YLR456WYLR456W 615 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MRPL16YBL038W 699 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YMR181CYMR181C 465 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 TPM1YNL079C 600 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YNR062CYNR062C 984 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YOR283WYOR283W 693 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 SUR1YPL057C 1149 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RIB5YBR256C 717 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 VID28YIL017C 2766 nt3.94□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 TPD3YAL016W 1908 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 ACE2YLR131C 2313 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 RPS14AYCR031C 414 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MAG1YER142C 891 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 VAR1Q0140 1197 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 MIG2YGL209W 1149 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 EMC4YGL231C 573 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 PRP21YJL203W 843 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 REE1YJL217W 597 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 KTR2YKR061W 1278 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NRK1YNL129W 723 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 GRX7YBR014C 612 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 DGA1YOR245C 1257 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NHX1YDR456W 1902 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 SDS23YGL056C 1584 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 BIK1YCL029C 1323 nt3.93□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NCR1YPL006W 3513 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 GLO3YER122C 1482 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 PTA1YAL043C 2358 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 ENP2YGR145W 2124 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NOC2YOR206W 2133 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 IZH3YLR023C 1632 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 PDR5YOR153W 4536 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 NKP1YDR383C 717 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YGR026WYGR026W 837 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 BNA1YJR025C 534 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YPT52YKR014C 705 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 YSF3YNL138W-A 258 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 ASI2YNL159C 870 nt3.92□□□□□ -1.78
LCB4Q12246 SGT1YOR057W 1188 nt3.92□□□□□ -1.78
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