Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YMR317WYMR317W 3423 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SLS1YLR139C 1932 nt3.8□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 URC2YDR520C 2319 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 HSE1YHL002W 1359 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SPT16YGL207W 3108 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 QRI7YDL104C 1224 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YDL158CYDL158C 309 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 NOP6YDL213C 678 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RRP17YDR412W 708 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YGL082WYGL082W 1146 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YIL175WYIL175W 318 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YNL013CYNL013C 378 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 CHO2YGR157W 2610 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 PBI1YPL272C 1554 nt3.79□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 GEM1YAL048C 1989 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 BOS1YLR078C 735 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 HMX1YLR205C 954 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 FYV6YNL133C 522 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 ICS2YBR157C 768 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SHQ1YIL104C 1524 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 RPA135YPR010C 3612 nt3.78□□□□□ -1.8
LSP1Q12230 SPT15YER148W 723 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 COX18YGR062C 951 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 HTD2YHR067W 843 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MER1YNL210W 813 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ATG34YOL083W 1239 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 TMC1YOR052C 453 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 OPY1YBR129C 987 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ROK1YGL171W 1695 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YFL040WYFL040W 1623 nt3.77□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 CLG1YGL215W 1359 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SAD1YFR005C 1347 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YNR066CYNR066C 1311 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SQS1YNL224C 2304 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YCR007CYCR007C 720 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 HAT2YEL056W 1206 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YFL051CYFL051C 483 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PRP18YGR006W 756 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 FOL3YMR113W 1284 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 IST1YNL265C 897 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RPC34YNR003C 954 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 IRC13YOR235W 315 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ATG5YPL149W 885 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YPL162CYPL162C 822 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ART10YLR392C 1557 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MSR1YHR091C 1932 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PFK26YIL107C 2484 nt3.76□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MEF1YLR069C 2286 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ULP1YPL020C 1866 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 HAP4YKL109W 1665 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PRP31YGR091W 1485 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RSM25YIL093C 795 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YAL065CYAL065C 387 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YNR071CYNR071C 1029 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YOR097CYOR097C 528 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SFG1YOR315W 1041 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ARO4YBR249C 1113 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RSF2YJR127C 4143 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 Q0255Q0255 1419 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YAK1YJL141C 2424 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 AIM14YGL160W 1713 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RRP5YMR229C 5190 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ECM18YDR125C 1362 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PUB1YNL016W 1362 nt3.75□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 STD1YOR047C 1335 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 EXO5YBR163W 1758 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 BUD6YLR319C 2367 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RPN2YIL075C 2838 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PWP2YCR057C 2772 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 TOS8YGL096W 831 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 COS8YHL048W 1146 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 FMC1YIL098C 468 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SMD3YLR147C 306 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SPC2YML055W 537 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 NUF2YOL069W 1356 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MAL12YGR292W 1755 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MAL32YBR299W 1755 nt3.74□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 GCN1YGL195W 8019 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PMS1YNL082W 2622 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 DET1YDR051C 1005 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RAD55YDR076W 1221 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YGR111WYGR111W 1203 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YPT35YHR105W 645 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 VPS25YJR102C 609 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PHD1YKL043W 1101 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RPS7AYOR096W 573 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RPN1YHR027C 2982 nt3.73□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 VPS33YLR396C 2076 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SCM4YGR049W 564 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 GTF1YGR102C 552 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 DOG2YHR043C 741 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 SGN1YIR001C 753 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YIR040CYIR040C 333 nt3.72□□□□□ -1.81
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