Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMPCAQ10713 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMPCAQ10713 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms