Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1B1Q10567 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1B1Q10567 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms