Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPAL4Q0D2K0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms