Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 SPC24YMR117C 642 nt2.71□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.71□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SQS1YNL224C 2304 nt2.71□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 KTR6YPL053C 1341 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SEC59YMR013C 1560 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YMR018WYMR018W 1545 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TFB2YPL122C 1542 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MGT1YDL200C 567 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TLG1YDR468C 675 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YIR014WYIR014W 729 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YAL069WYAL069W 315 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 BUR2YLR226W 1188 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TAF4YMR005W 1167 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 OCA2YNL056W 594 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CPR8YNR028W 927 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YPR136CYPR136C 513 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MEK1YOR351C 1494 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YDR089WYDR089W 2610 nt2.7□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CCM1YGR150C 2595 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SKN7YHR206W 1869 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RGC1YPR115W 3252 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MED2YDL005C 1296 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RRP8YDR083W 1179 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 KXD1YGL079W 657 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YGR107WYGR107W 450 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RPC37YKR025W 849 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TVP18YMR071C 504 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MRPL16YBL038W 699 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YOR082CYOR082C 342 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 PNT1YOR266W 1272 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 OXR1YPL196W 822 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 FLO1YAR050W 4614 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CTM1YHR109W 1758 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ACK1YDL203C 1872 nt2.69□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 VTC4YJL012C 2166 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 snR63snR63 255 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 QRI7YDL104C 1224 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 APA2YDR530C 978 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 AML1YGR001C 747 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RPC17YJL011C 486 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 HRT3YLR097C 1035 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 REX3YLR107W 1215 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 AHP1YLR109W 531 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YBL081WYBL081W 1107 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ARO4YBR249C 1113 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ACA1YER045C 1470 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YAK1YJL141C 2424 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ALG8YOR067C 1734 nt2.68□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 DSS1YMR287C 2910 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 LIF1YGL090W 1266 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TAM41YGR046W 1158 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YHL005CYHL005C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MSA2YKR077W 1092 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 PBA1YLR199C 831 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YLR444CYLR444C 303 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 MRPS17YMR188C 714 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RLP7YNL002C 969 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 AEP2YMR282C 1743 nt2.67□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SET1YHR119W 3243 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 XRN1YGL173C 4587 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CSR2YPR030W 3366 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SEC15YGL233W 2733 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 DYN1YKR054C 12279 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 BCS1YDR375C 1371 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TRM12YML005W 1389 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ARG2YJL071W 1725 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CLB3YDL155W 1284 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 DET1YDR051C 1005 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TGL2YDR058C 981 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 PPH3YDR075W 927 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 ECO1YFR027W 846 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 APC9YLR102C 798 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 PCD1YLR151C 1023 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 RPC34YNR003C 954 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 HUB1YNR032C-A 222 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 CYC2YOR037W 1101 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 DGA1YOR245C 1257 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 TPK2YPL203W 1143 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 FRE4YNR060W 2160 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 POL2YNL262W 6669 nt2.66□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 PFK26YIL107C 2484 nt2.65□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YKL222CYKL222C 2118 nt2.65□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 YOR365CYOR365C 2112 nt2.65□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SNQ2YDR011W 4506 nt2.65□□□□□ -1.98
NIP7Q08962 SIN4YNL236W 2925 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PCL2YDL127W 927 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDL162CYDL162C 357 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 NKP1YDR383C 717 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PEX11YOL147C 711 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YOR238WYOR238W 912 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YOR263CYOR263C 408 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 CAF20YOR276W 486 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YPL071CYPL071C 471 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 COM2YER130C 1332 nt2.65□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 MSS4YDR208W 2340 nt2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.4 ms