Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDR1Q08345 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDR1Q08345 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms