Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 IMP4YNL075W 873 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PPT2YPL148C 522 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YBR116CYBR116C 528 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PRP3YDR473C 1410 nt2.76□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 CDC20YGL116W 1833 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YDL162CYDL162C 357 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RAD55YDR076W 1221 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YPR1YDR368W 939 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 COS8YHL048W 1146 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PAN5YHR063C 1140 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YJL028WYJL028W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RPL6AYML073C 531 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YMR084WYMR084W 789 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 BMT2YBR141C 1014 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 GAT2YMR136W 1683 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YFL040WYFL040W 1623 nt2.75□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RRT13YER066W 558 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PPX1YHR201C 1194 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YIL089WYIL089W 618 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YLR225CYLR225C 1224 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YAR069CYAR069C 294 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YOR186WYOR186W 435 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 OXR1YPL196W 822 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RPA190YOR341W 4995 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 MIC60YKR016W 1623 nt2.74□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 HMS1YOR032C 1305 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PAF1YBR279W 1338 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 MDV1YJL112W 2145 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 SEC65YML105C 822 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YOR385WYOR385W 873 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YPK3YBR028C 1578 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 DUF1YOL087C 3351 nt2.73□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 HEH2YDR458C 1992 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 OAF3YKR064W 2592 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RPS14AYCR031C 414 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 RCR2YDR003W 633 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YDR133CYDR133C 336 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 EPL1YFL024C 2499 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PNC1YGL037C 651 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 HFD1YMR110C 1599 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 TIF34YMR146C 1044 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 MET16YPR167C 786 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YGR067CYGR067C 2415 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 PUF6YDR496C 1971 nt2.72□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 YBR238CYBR238C 2196 nt2.71□□□□□ -1.97
NEJ1Q06148 KRE2YDR483W 1329 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ARG2YJL071W 1725 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RRP17YDR412W 708 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YGR219WYGR219W 342 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SDP1YIL113W 630 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 VPS28YPL065W 729 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YMR1YJR110W 2067 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 CYR1YJL005W 6081 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RAX2YLR084C 3663 nt2.71□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 CLB5YPR120C 1308 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 PFF1YBR074W 2931 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ERV29YGR284C 933 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 THP2YHR167W 786 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YIL169CYIL169C 2988 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 TAF14YPL129W 735 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ATP25YMR098C 1839 nt2.7□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 NDC80YIL144W 2076 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MSM1YGR171C 1728 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YGL101WYGL101W 648 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 TDA8YAL064C-A 381 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 TAF4YMR005W 1167 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RPA43YOR340C 981 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MCM16YPR046W 546 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 BEM4YPL161C 1902 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 STE6YKL209C 3873 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 GYP7YDL234C 2241 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 TDA1YMR291W 1761 nt2.69□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 OPI6YDL096C 327 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 HAT2YEL056W 1206 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MRPS35YGR165W 1038 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 ARC15YIL062C 465 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 YUH1YJR099W 711 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 AIM25YJR100C 984 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SWD2YKL018W 990 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 AIM26YKL037W 357 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 SPC24YMR117C 642 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MCA1YOR197W 1299 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 RGC1YPR115W 3252 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 UBP8YMR223W 1416 nt2.68□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 DAP2YHR028C 2457 nt2.67□□□□□ -1.98
NEJ1Q06148 MGA1YGR249W 1371 nt2.67□□□□□ -1.98
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