Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDSRQ06136 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDSRQ06136 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms