Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms