Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT17Q04695 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT17Q04695 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms