Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBE1Q04446 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms