Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNC4Q03721 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNC4Q03721 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms