Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA6Q01524 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms