Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD1P98174 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD1P98174 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD1P98174 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD1P98174 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD1P98174 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD1P98174 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD1P98174 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms