Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRX5P78411 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX5P78411 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX5P78411 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX5P78411 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX5P78411 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX5P78411 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX5P78411 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX5P78411 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX5P78411 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX5P78411 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms