Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSNK2A1P68400 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms